MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p58

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017723	GTT	2	6	19	24	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615183
2	NC_017723	CGTC	2	8	55	62	0 %	25 %	25 %	50 %	387615183
3	NC_017723	AGAT	2	8	99	106	50 %	25 %	25 %	0 %	387615183
4	NC_017723	CGG	2	6	112	117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615183
5	NC_017723	CCG	2	6	192	197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615183
6	NC_017723	TTC	2	6	260	265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615183
7	NC_017723	TAG	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615184
8	NC_017723	T	7	7	424	430	0 %	100 %	0 %	0 %	387615184
9	NC_017723	CGGCTC	2	12	434	445	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387615184
10	NC_017723	GCT	3	9	448	456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
11	NC_017723	TGC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
12	NC_017723	GC	4	8	540	547	0 %	0 %	50 %	50 %	387615184
13	NC_017723	CT	3	6	551	556	0 %	50 %	0 %	50 %	387615184
14	NC_017723	AC	3	6	577	582	50 %	0 %	0 %	50 %	387615184
15	NC_017723	TGC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
16	NC_017723	GCT	2	6	634	639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
17	NC_017723	CTG	3	9	658	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
18	NC_017723	CT	3	6	689	694	0 %	50 %	0 %	50 %	387615184
19	NC_017723	GTCG	2	8	820	827	0 %	25 %	50 %	25 %	387615184
20	NC_017723	GCA	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
21	NC_017723	CCA	2	6	870	875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615184
22	NC_017723	GTC	2	6	895	900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
23	NC_017723	CGC	2	6	921	926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615184
24	NC_017723	GCT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
25	NC_017723	TGA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615184
26	NC_017723	CAG	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
27	NC_017723	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
28	NC_017723	GCC	2	6	1304	1309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615184
29	NC_017723	ATGCTG	2	12	1323	1334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387615184
30	NC_017723	CAC	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615184
31	NC_017723	CTG	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
32	NC_017723	TCA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615184
33	NC_017723	CGG	2	6	1435	1440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615184
34	NC_017723	GCC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615184
35	NC_017723	GCGG	2	8	1495	1502	0 %	0 %	75 %	25 %	387615184
36	NC_017723	CAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
37	NC_017723	CAG	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
38	NC_017723	GTGA	2	8	1942	1949	25 %	25 %	50 %	0 %	387615184
39	NC_017723	CAG	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615185
40	NC_017723	ACG	2	6	2011	2016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615185
41	NC_017723	AGC	2	6	2017	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615185
42	NC_017723	GTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615185
43	NC_017723	GT	3	6	2155	2160	0 %	50 %	50 %	0 %	387615185
44	NC_017723	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017723	CAC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017723	G	6	6	2344	2349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017723	TG	3	6	2399	2404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017723	GTA	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017723	A	8	8	2452	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017723	GTT	2	6	2493	2498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017723	GTA	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017723	TAT	2	6	2592	2597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017723	AG	3	6	2657	2662	50 %	0 %	50 %	0 %	387615186
54	NC_017723	TA	3	6	2702	2707	50 %	50 %	0 %	0 %	387615186
55	NC_017723	T	7	7	2725	2731	0 %	100 %	0 %	0 %	387615186
56	NC_017723	AAGAAA	2	12	2742	2753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387615186
57	NC_017723	AAAG	2	8	2779	2786	75 %	0 %	25 %	0 %	387615186
58	NC_017723	ATA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615186
59	NC_017723	A	8	8	2844	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	387615187
60	NC_017723	TTA	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615187
61	NC_017723	ATTCAA	2	12	2865	2876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387615187
62	NC_017723	ATT	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615187
63	NC_017723	ATG	2	6	3006	3011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
64	NC_017723	A	8	8	3060	3067	100 %	0 %	0 %	0 %	387615187
65	NC_017723	TAAA	2	8	3090	3097	75 %	25 %	0 %	0 %	387615187
66	NC_017723	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615187
67	NC_017723	AGAA	2	8	3153	3160	75 %	0 %	25 %	0 %	387615187
68	NC_017723	GGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615187
69	NC_017723	AAAG	2	8	3205	3212	75 %	0 %	25 %	0 %	387615187
70	NC_017723	AAAAAC	2	12	3226	3237	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387615187
71	NC_017723	CAT	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
72	NC_017723	AT	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	387615187
73	NC_017723	AGG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615187
74	NC_017723	ATA	2	6	3395	3400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615187
75	NC_017723	TGA	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
76	NC_017723	TGA	3	9	3418	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
77	NC_017723	CAAG	2	8	3441	3448	50 %	0 %	25 %	25 %	387615187
78	NC_017723	A	6	6	3475	3480	100 %	0 %	0 %	0 %	387615187
79	NC_017723	A	7	7	3492	3498	100 %	0 %	0 %	0 %	387615187
80	NC_017723	A	7	7	3509	3515	100 %	0 %	0 %	0 %	387615187
81	NC_017723	T	6	6	3524	3529	0 %	100 %	0 %	0 %	387615187
82	NC_017723	TGC	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615187
83	NC_017723	CTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615187
84	NC_017723	GAT	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
85	NC_017723	TCT	2	6	3664	3669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615187
86	NC_017723	ATG	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
87	NC_017723	G	6	6	3704	3709	0 %	0 %	100 %	0 %	387615187
88	NC_017723	TA	3	6	3713	3718	50 %	50 %	0 %	0 %	387615187
89	NC_017723	TGA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
90	NC_017723	ATC	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
91	NC_017723	CAA	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
92	NC_017723	A	8	8	3796	3803	100 %	0 %	0 %	0 %	387615187
93	NC_017723	TGA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
94	NC_017723	AAC	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
95	NC_017723	ATC	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
96	NC_017723	AAC	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
97	NC_017723	ATC	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
98	NC_017723	ACA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
99	NC_017723	AGCTT	2	10	4124	4133	20 %	40 %	20 %	20 %	387615187
100	NC_017723	ACC	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615187
101	NC_017723	AGA	2	6	4165	4170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615187
102	NC_017723	AAG	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615187
103	NC_017723	TTC	2	6	4229	4234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615187
104	NC_017723	GAAA	2	8	4247	4254	75 %	0 %	25 %	0 %	387615187
105	NC_017723	TTG	2	6	4350	4355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615187
106	NC_017723	T	6	6	4363	4368	0 %	100 %	0 %	0 %	387615187
107	NC_017723	AAG	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615188
108	NC_017723	CTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615188
109	NC_017723	T	6	6	4447	4452	0 %	100 %	0 %	0 %	387615188
110	NC_017723	CTTC	2	8	4464	4471	0 %	50 %	0 %	50 %	387615188
111	NC_017723	GTC	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615188
112	NC_017723	CCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615188
113	NC_017723	T	6	6	4568	4573	0 %	100 %	0 %	0 %	387615188
114	NC_017723	CGC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615188
115	NC_017723	CAGC	2	8	4859	4866	25 %	0 %	25 %	50 %	387615188
116	NC_017723	T	6	6	4968	4973	0 %	100 %	0 %	0 %	387615188
117	NC_017723	CGG	3	9	4991	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615188
118	NC_017723	CAG	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615188
119	NC_017723	CCAG	2	8	5168	5175	25 %	0 %	25 %	50 %	387615188
120	NC_017723	ATC	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615188
121	NC_017723	TGT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017723	T	6	6	5450	5455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017723	GCC	2	6	5523	5528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615189
124	NC_017723	GAA	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615189
125	NC_017723	CGC	2	6	5576	5581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615189
126	NC_017723	CT	3	6	5732	5737	0 %	50 %	0 %	50 %	387615189
127	NC_017723	CTT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615189
128	NC_017723	A	7	7	5789	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	387615189

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.